Le président est nommé pour un mandat d'une durée de cinq ans renouvelable une fois, par décret du président de la République pris sur le rapport du ministre chargé de l'enseignement supérieur, après appel de candidatures publié au Journal officiel de la République française.
Il est choisi parmi les personnalités ayant une compétence scientifique dans les domaines d'activité de l'école.
Voir le décret n° 2011-21 du 5 janvier 2011