Une quarantaine de doctorants sont actuellement accueillis à l'antenne de Bretagne de l'ENS Cachan avec des statuts variables : chercheur à plein temps à l'antenne même, ou moniteur (et parfois les deux), ou tout simplement encadré par un directeur de thèse de l'ENS, avec présence ou non sur le site. Ils sont le plus souvent accueillis dans les laboratoires de l'antenne et les écoles doctorales associées, en particulier :

• L'École doctorale sciences pratique (EDSP) de l'ENS Cachan qui accueille des doctorants sur ses deux sites (Cachan et Ker lann).

• l'École doctorale MATISSE, spécifique du site de Bretagne, qui regroupe plus de 500 doctorants dans un spectre large des sciences dures contemporaines: mathématiques, informatique, robotique, traitement du signal et des images, électronique et micro-électronique, opto-électronique et micro-ondes.

• Les doctorants des disciplines économiques peuvent également être accueillis dans l'École doctorale SHOS (Sciences de l'homme, des organisations et de la société) et encadrés par  des chercheurs du département Droit - Économie - Gestion de l'antenne.

Toutes les écoles doctorales du site rennais sont regroupées dans un Collège des écoles doctorales qui mutualise un certain nombre de moyens et assure la coordination de l'ensemble des études doctorales du site.